Два брата-водопроводчика из Бруклина, Марио и Луиджи, неожиданно оказываются в совершенно новом мире, скрытом под землёй. Это загадочное измерение населено людьми-ящерицами, которые являются потомками динозавров, и управляется жестоким тираном по имени Купа. Эти существа стремятся вырваться из своего подземного пленения и под предводительством Купы намерены захватить Землю.
Ключ к спасению этого мира и самой Земли находится в руках прекрасной принцессы Дэйзи, которая носит на себе осколок хрустального метеорита, обладающего невероятной силой. Когда братья узнают о её пленении, они понимают, что должны не только спасти принцессу, но и защитить человечество от угрозы, исходящей от Купы и его армии.
В ходе своего приключения Марио и Луиджи сталкиваются с множеством препятствий и опасностей, но их решимость и братская связь помогают им преодолеть все трудности. Братья осознают, что их задача не просто освободить Дэйзи, но и восстановить мир и гармонию в этом удивительном, но опасном мире. Сражаясь с врагами и преодолевая испытания, они становятся настоящими героями, готовыми на всё ради спасения принцессы и защиты своей планеты. В конце концов, именно их смелость и дружба помогают изменить ход событий и вернуть мир в оба измерения.