Кайто Даймон – десятиклассник, обладающий выдающимися аналитическими способностями, но не интересующийся традиционными школьными предметами. Его страсть – разгадывание головоломок и загадок, что делает его настоящим хулиганом в глазах учителей. Однако его верная подруга детства, энергичная Ноноха Ито, заботится о нем и старается направить его на путь учёбы.
Учебное заведение, в котором они учатся – академия «Квадратный корень» – привлекает множество любителей головоломок. Здесь Кайто сталкивается с Содзи Дзикукава, президентом школьного Совета и клуба головоломок, который бросает ему вызов. Чтобы доказать свою силу, Кайто попадает в опасный лабиринт, где, преодолев все трудности с помощью Нонохи, получает таинственное устройство «контракт Орфея». Это дает ему возможность раскрыть потенциал своего разума, который называется «фи брэйн».
Теперь Кайто становится одним из Решателей – избранных, способных противостоять коварным планам загадочной организации, создающей неразрешимые головоломки. Под псевдонимом Эйнштейн и с поддержкой Нонохи он начинает новую жизнь в мире, где необходимо завоевывать уважение и подтверждать свои способности, решая все более сложные задачи. Путь к разгадке «мистерии Бога» требует не только умения, но и смекалки. Однако истинные намерения директора академии и глобальной тайной организации остаются загадкой, что добавляет интригу к его приключениям.
