В фильме «Стеклянный цветок — разрушитель миров» зрители погружаются в удивительное пространство, называемое Ящик знаний. Это место без гравитации наполнено множеством ярких огней, сверкающих всеми цветами радуги. Внутри Ящика сосредоточено множество временных потоков и параллельных миров, которые служат домом для многих существ. Главные героини, Дуал и Дороти, ведут борьбу с врагами, известными как Вирусы. Эти сущности угрожают существованию различных миров, и задача девушек заключается в их уничтожении.
Однажды Дуал и Дороти ощущают появление нового Вируса и спешат на место его активности. Там они обнаруживают девушку, подвергшуюся нападению. После успешного спасения, героини остаются рядом, ожидая её пробуждения, чтобы выяснить, кто она и откуда пришла. Когда девушка приходит в себя, она называет себя Римо и с тревогой сообщает, что ей необходимо вернуться в цветочный сад.
Этот момент становится поворотным в их приключении, так как Римо приносит с собой загадку, которую необходимо разгадать. С каждой минутой становится ясно, что её история и миссия могут повлиять на судьбы многих миров, находящихся под угрозой. Дуал и Дороти, обретя новую союзницу, должны не только сразиться с Вирусами, но и разобраться в тайнах, которые окружают Римо и её связь с цветочным садом. Их путь полон неожиданных открытий и опасностей, которые требуют смелости и единства.
