В мире, где ниндзюцу не исчезло, а лишь скрывается в тени, продолжает существовать уникальная традиция. После эпохи Токугава ниндзя нашли новое призвание, служа правительству, но их обучение происходит под маской обычных школьных занятий. Одним из таких учебных заведений является токийская академия Хандзо, где под руководством Кирия-сэнсэя обучаются пять девушек.
Среди них – простая и добродушная Асука, элегантная и манерная Икаруга, свободолюбивая и смелая Кацураги, загадочная одноглазая Ягю и милая Хибари. После успешной сдачи очередного экзамена, сэнсэй решает поощрить учениц и отправляет их на, казалось бы, простую миссию в торговый район. Однако в ходе выполнения задания девочки сталкиваются с неожиданными трудностями.
Оказывается, среди японских ниндзя много тех, кто не придерживается высоких идеалов добра и справедливости. В ходе своего приключения героини понимают, что мир, в котором они живут, полон неожиданностей и противоречий. Каждая из них должна не только сразиться с внешними врагами, но и разобраться в своих собственных чувствах, целях и ценностях.
Соперничество, дружба и внутренние конфликты становятся неотъемлемой частью их жизни. Девушки учатся не только мастерству ниндзя, но и важности доверия, поддержки и понимания друг друга. Их путь полон испытаний, которые помогут раскрыть истинную силу каждой из них, а также покажут, что даже в мире теней можно найти светлые моменты.