Действие фильма "Красная фракция: Происхождение" разворачивается спустя 25 лет после того, как Алек Мэйсон освободил Марсианские Колонии. Прошло 12 лет с тех пор, как его жизнь разрушилась: мстительные враги лишили его жены, а дочь Лира была похищена. Алек остался один, погружённый в горе и страдания.
Теперь на первый план выходит Джейк Мэйсон, сын Алека и офицер войск Red Faction. Его жизнь меняется, когда он получает шокирующую новость о том, что его сестра всё ещё жива. После столь долгого времени, полного надежд и разочарований, Джейк решает отправиться на поиски Лиры. Однако он вскоре осознает, что мир вокруг него изменился: на планете появился новый, мощный враг.
В ходе своего путешествия Джейк сталкивается с опасностями и предательствами, которые поджидают его на каждом шагу. Его сестра, о которой он так долго мечтал, оказывается не тем, кем он её представлял. Лира стала хладнокровным солдатом, верным своему делу и клятве уничтожить Red Faction. Джейку предстоит не только найти её, но и разобраться в том, что произошло с их семьей, и каким образом они оказались по разные стороны конфликта.
Фильм погружает зрителя в мир борьбы, преданности и открытий, заставляя задуматься о том, как далеко может зайти человек ради своих убеждений и как сложно бывает восстановить утраченные связи.
