Действие фильма "Железнодорожные войны" происходит в альтернативной реальности, где Япония не провела приватизацию своих железных дорог. Главный персонаж, Такаяма Наохито, является обычным старшеклассником, мечтающим о престижной карьере на японских национальных железных дорогах, что сулит ему стабильное и обеспеченное будущее. Чтобы приблизиться к своей цели, он устраивается стажером в службу безопасности железной дороги.
Однако в процессе работы Наохито сталкивается с неожиданными трудностями. В основном в службе работают привлекательные девушки, и среди них есть такие, которые испытывают неприязнь к мужчинам. Одной из таких является Сакураи, чье отношение к Наохито становится для него настоящим испытанием. На фоне этих личных конфликтов на горизонте появляется группа экстремистов, называющая себя "RJ". Их цель - разделить и приватизировать японские железные дороги, что ставит под угрозу мечты Наохито и стабильность всей системы.
Фильм исследует темы борьбы за идеалы, преданности и личных взаимоотношений на фоне серьезных общественных изменений. Наохито оказывается втянут в конфликт между традициями и новыми идеями, что заставляет его переосмыслить свои приоритеты и понять, что истинная ценность не всегда заключается в материальном благополучии. Он должен найти в себе силы, чтобы противостоять не только внешним угрозам, но и внутренним сомнениям, что делает его путь к мечте еще более сложным и многослойным.