В конце XX века сэр Интегра Хеллсинг, будучи ещё девочкой, унаследовала от своего отца руководство тайной организацией «Хеллсинг», которая на протяжении более ста лет защищает Британию от нежити. В её подчинении находится могущественный вампир Алукард, который служит ей верой и правдой. После одной из операций Интегра замечает, что случаи появления вампиров и их зомби-слуг стали значительно чаще.
В это время организация сталкивается с новыми угрозами. На сцену выходит 13-й отдел Ватикана, известный как «Искариот», возглавляемый паладином Александром Андерсоном. Эти боевые маги начинают активно противостоять «Хеллсинг», что приводит к напряжённым столкновениям. Кроме того, появляется таинственная организация «Миллениум», которая также стремится посягнуть на мир, в котором живут люди и нежить.
Интегра и её союзники оказываются в центре жестокой борьбы, где им предстоит не только защищать Британию, но и выяснить, кто стоит за новыми угрозами. Конфликт между различными силами обостряется, и Интегра должна проявить все свои лидерские качества, чтобы справиться с нарастающей опасностью и сохранить равновесие в мире, где вампиры и магия становятся реальностью.