В фильме "Видоизменённый углерод: Восстановленный" действие разворачивается вокруг Такэси Ковача, бывшего бойца сопротивления, который теперь работает наёмником. Он получает новое тело и отправляется на планету Латимер, где его навыки становятся востребованными. Заказчиком выступает влиятельный босс якудза, который нуждается в защите своей подопечной — девушке-татуировщице, связанной с кланом Мидзуно.
Ковачу поручено важное задание: обеспечить безопасность этой молодой женщины, ведь на неё уже неоднократно совершались нападения со стороны ниндзя, стремящихся помешать её работе и церемонии, которая должна состояться в ближайшее время. Эта церемония приурочена к назначению нового босса клана, и любые попытки сорвать её могут иметь серьезные последствия для всех участников.
На протяжении всей истории Такэси сталкивается с множеством опасностей и интриг, которые окружают его подопечную. Ему необходимо не только защищать её, но и разобраться в запутанных отношениях между кланами, а также в собственных чувствах и мотивациях. В процессе выполнения задания Ковач начинает осознавать, что его прошлое не отпускает его, и он все больше вовлекается в сложные конфликты, которые затрагивают не только его, но и судьбы других людей.
Фильм погружает зрителя в мир, где технологии и человеческие эмоции переплетаются, создавая напряжённую атмосферу. Такэси Ковач становится не просто защитником, но и ключевой фигурой в борьбе за выживание и справедливость в этом мрачном будущем.