Два года спустя после последних событий, жизнь героев кардинально изменилась. Гинтоки отправился в путешествие по Альтане, в то время как Кагура скитается по космосу в поисках способа вернуть Садахару к прежнему состоянию. Шинпачи, в свою очередь, старается сохранить остатки их общего дома, который постепенно разрушается. Тем временем, над Эдо нависает новая угроза: остатки Тендошу, воспользовавшись неожиданной атакой, готовятся снова использовать Альтану в своих злых намерениях.
Ситуация становится критической, и друзьям предстоит снова объединить усилия ради защиты родного города. Их цель — выполнить заветное желание Шоё Йошиды и одновременно спасти собственное будущее. Неизвестно, что ждет их впереди, но они готовы сразиться с любыми трудностями. В этот раз им предстоит столкнуться с мощными противниками и преодолеть множество испытаний, чтобы отстоять свои идеалы и защитить тех, кто им дорог.
Собравшись вместе, они вновь становятся командой, готовой к борьбе. Каждый из них осознает, что на кону стоят не только их жизни, но и судьба всего мира. Друзья должны будут проявить все свои силы, чтобы противостоять тем, кто желает разрушить все, что они построили. В этот решающий момент они должны вспомнить о своих ценностях и о том, что значит быть настоящими защитниками Эдо.
