Действие фильма разворачивается спустя 31 год после катастрофических событий Третьей мировой войны, когда Япония была уничтожена ядерной бомбой. На руинах старой столицы возникает Новый Токио, который, несмотря на внешний порядок, представляет собой авторитарное государство, жестко подавляющее любые протесты и мятежи. В этом обществе активно проводятся эксперименты в области парапсихологии, цель которых — создание идеального оружия.
Военные, возглавляемые полковником Сикисимой, занимаются разработкой биологических технологий, что приводит к конфликту с правительственными структурами. На фоне этих событий в стране начинает развиваться культ, посвященный загадочному существу по имени Акира. Сторонники культа верят, что возвращение Акиры сможет разрешить все проблемы, с которыми сталкивается Япония, и станет ключом к спасению нации.
В этом напряженном и мрачном контексте разворачиваются события, полные борьбы за выживание, предательства и попыток восстановить справедливость. Персонажи фильма сталкиваются с выбором между долгом и моралью, а их судьбы переплетаются в хаосе, который охватывает страну. В конечном итоге, исследование человеческой природы и границ власти становится центральной темой, заставляя зрителей задуматься о последствиях научных экспериментов и о том, что значит быть человеком в условиях тоталитаризма.