Фильм «Через Гоби и Хинган» рассказывает о событиях, связанных с завершающим этапом Второй мировой войны, когда советские и монгольские войска одержали победу над элитной Квантунской армией Японии. В это время в секретной лаборатории японского генерала Исии Сиро разрабатывалось опасное бактериологическое оружие, для испытаний которого использовались военнопленные и политические заключенные.
Главный герой, врач-эпидемиолог Дмитрий Соколов, получает задание разгадать тайны этой лаборатории. Его работа становится не только научным расследованием, но и борьбой за жизнь и свободу многих людей. Соколов осознает, что его миссия может стоить ему жизни, но он продолжает двигаться вперед, понимая важность раскрытия этой угрозы.
Одновременно с его усилиями, советские и монгольские силы осуществляют грандиозную военную операцию, проходя через труднопроходимые пески Гоби и горные хребты Хингана. Эта операция не только демонстрирует высокую военную тактику и сплоченность войск, но и служит предупреждением для Японии о последствиях использования бактериологического оружия.
Финальный этап борьбы становится не только триумфом над врагом, но и важным шагом к окончанию войны. В итоге, благодаря мужеству и самоотверженности Соколова, а также совместным усилиям советских и монгольских бойцов, удается предотвратить распространение ужасной угрозы, что вносит значительный вклад в победу над японской агрессией.