Действие происходит через двести лет после событий на планете-тюрьме, когда группа ученых, находящихся под контролем военных, решает клонировать Эллен Рипли. Их целью является получение потомства инопланетного существа, чтобы использовать его в своих исследованиях. После успешного клонирования Рипли, она оказывается в совершенно новом мире, где наука и военные амбиции переплетаются.
Однако вскоре выясняется, что инопланетный детеныш, который был извлечен из Рипли, начинает развиваться и размножаться, создавая новую, опасную породу. Эта смесь кровожадного пришельца и человеческой сущности становится настоящей угрозой. С каждым новым поколением монстров растет не только их сила, но и умственные способности, что делает их еще более опасными.
В то время как ученые пытаются контролировать ситуацию, Рипли, обладая уникальными способностями и связью с инопланетным существом, начинает осознавать всю серьезность происходящего. Она понимает, что ее жизнь и судьба человечества находятся под угрозой. В борьбе за выживание Рипли сталкивается с моральными дилеммами, касающимися природы человека и инопланетянина.
Конфликт между человечеством и созданными ими же монстрами приводит к напряженным моментам, когда становится очевидно, что контролировать ситуацию невозможно. В конечном итоге, Рипли должна сделать выбор, который повлияет на будущее не только ее, но и всей цивилизации. Этот фильм ставит под сомнение границы между человеком и чудовищем, исследуя темные стороны научных экспериментов и их последствия.