Действие фильма разворачивается в 1327 году в отдаленном монастыре на севере Италии. Здесь встречаются монах-францисканец Вильгельм Баскервильский и его молодой ученик Адсон. Они прибыли для участия в переговорах, касающихся еретических взглядов, которые собираются осудить представители папы Иоанна XXII и ордена.
Однако, в этом изолированном и величественном монастыре происходит таинственное убийство, которое нарушает спокойствие обители. Вильгельм и Адсон начинают собственное расследование, пытаясь раскрыть преступление. Их путь полон загадочных событий и подозрительных обстоятельств, которые ставят под сомнение доверие между монахами.
С каждым шагом они обнаруживают, что в стенах монастыря скрываются мрачные тайны и противоречивые интересы. Внутренние конфликты среди монахов, а также борьба за власть и влияние создают атмосферу напряженности. Вильгельм, обладая проницательным умом и навыками логического мышления, пытается разгадать сложные головоломки, в то время как Адсон, в свою очередь, исследует духовные аспекты происходящего.
На фоне средневековой философии и религиозных споров разворачивается не только детективная линия, но и глубокая рефлексия о вере, знании и природе зла. По мере того как расследование углубляется, становится ясно, что каждое открытие ведет к новым вопросам, и вскоре монахам предстоит столкнуться с собственными внутренними демонами.