В Германии XVII века, на фоне ужасов Тридцатилетней войны и эпидемии чумы, 13-летний Крабат оказывается без родителей. В поисках укрытия и пищи, он неожиданно находит приют на загадочной мельнице, где становится учеником её владельца. Однако вскоре мальчик осознает, что это место не так уж простое: мельница оказывается настоящей школой черной магии, а её хозяин — Мастер, обладающий темными знаниями.
Крабат быстро погружается в мир магии, где он изучает заклинания и тайные искусства. Но цена за обучение оказывается слишком высокой. Каждый урок требует от него не только усилий и сосредоточенности, но и жертв. Мальчику приходится сталкиваться с моральными дилеммами, которые ставят под сомнение его внутренние убеждения и стремления. В процессе обучения Крабат начинает осознавать, что магия может быть как даром, так и проклятием.
С каждым днем его жизнь становится все более сложной, и он понимает, что, чтобы выжить в этом мире, ему нужно не только учиться, но и находить способы противостоять тёмным силам, которые угрожают ему и его новым друзьям. Крабат оказывается перед выбором: продолжать путь, который может привести к его гибели, или попытаться разорвать связь с Мастером и найти свой собственный путь. В этом опасном путешествии ему предстоит не только овладеть магией, но и найти в себе силы для борьбы за свою свободу и спасение.