В фильме «Черепашки-ниндзя 2» Шреддер, заручившись поддержкой оставшихся членов Клана Фут и профессора Стокмана, разрабатывает хитроумный план побега из тюрьмы. Во время транспортировки ему удается осуществить задуманное, благодаря устройству, созданному Стокманом. Эйприл, находясь на шаг впереди, получает доступ к секретным документам профессора и узнает о предстоящем побеге.
Черепашки-ниндзя, на обновленном фургоне-мусоровозе, спешат на помощь, но, к сожалению, не успевают предотвратить побег Шреддера. В самый последний момент он использует портал, чтобы исчезнуть из их поля зрения. Это событие становится для черепашек сигналом к действию. Они понимают, что пришло время оставить в стороне мелкие дела и вновь продемонстрировать свои способности.
В ходе своего приключения герои сталкиваются с новыми вызовами и врагами, которые требуют от них максимальной концентрации и командной работы. Ситуация становится все более напряженной, и черепашки должны проявить смекалку и силу, чтобы остановить злодеев и защитить город от наступающей угрозы. Их дружба и преданность друг другу становятся ключевыми факторами в этой борьбе.
В конечном итоге, черепашки-ниндзя вновь доказывают, что даже в самых сложных обстоятельствах они способны на героические поступки, готовые сразиться за справедливость и защитить тех, кто в этом нуждается.