Фильм "Аптекарь Мельхиор. Призрак" продолжает историю аптекаря Мельхиора Вакенстеде, который занимается расследованием преступлений в Таллине начала 15 века. В этом выпуске его внимание привлекает загадочное происшествие, связанное с призраком Доротеи, дочери состоятельного купца, которая трагически утонула. Ночной сторож, ставший свидетелем появления духа, в ужасе обращается за помощью.
Ситуация осложняется, когда в высокой башне убивают охранника, а ряд других людей погибает при странных обстоятельствах. Мельхиор начинает распутывать сложный клубок событий, сталкиваясь с различными персонажами, такими как блудница, священник, иностранный художник и безумный еретик. Каждый из них добавляет свои оттенки к расследованию и открывает новые грани происходящего.
По мере продвижения в расследовании аптекарю предстоит посетить монастырь Пирита, где мрачные коридоры скрывают опасные тайны, давно забытые. Однако личные переживания Мельхиора также не оставляют его в покое: он мучается вопросом, почему его возлюбленная Кетерлин внезапно решила разорвать помолвку. Эта ситуация добавляет эмоциональную нагрузку к его поискам правды о призраке и преступлениях, которые терзают город. В итоге, Мельхиор оказывается втянутым в опасную игру, где каждое решение может стоить ему жизни.
