После победы над последним Ангелом, организация NERV сталкивается с новой, более серьезной угрозой. Гэндо Икари начинает подготовку к Третьему удару, когда на их подземный штаб происходит атака со стороны боевиков Seele. В это время Рэй Аянами сливается с Лилит, что приводит к неожиданным последствиям для всех участников событий.
Синдзи, главный герой, оказывается перед сложным выбором, который может определить судьбу человечества. Он должен решить, стоит ли продолжать существование людей или же позволить им исчезнуть. Этот выбор не только затрагивает его личные переживания и внутренние конфликты, но и ставит под сомнение все основы человеческой жизни.
Фильм погружает зрителя в мир глубоких философских размышлений, исследуя темы одиночества, страха и стремления к пониманию. В то время как внешние угрозы становятся все более ощутимыми, внутренние демоны героев также выходят на поверхность. Каждое действие и решение Синдзи имеют огромные последствия, и он осознает, что его личные переживания переплетаются с судьбой всего человечества.
В конечном итоге, "Конец Евангелиона" представляет собой не только финал истории о борьбе с Ангелами, но и глубокое размышление о природе человека, его желаниях и страхах. Это произведение оставляет зрителя с вопросами о смысле жизни, о том, что значит быть человеком, и о том, как наши выборы могут изменить мир вокруг нас.