Четырнадцатилетний Синдзи Икари становится пилотом робота, известного как Евангелион. Он является сыном Гэндо Икари, руководителя организации NERV. Синдзи — замкнутый и неуверенный в себе подросток, который страдает от эмоциональной дистанции с отцом. Его внутренние переживания и чувство одиночества не уникальны, поскольку подобные проблемы испытывают и другие молодые пилоты, а также взрослые сотрудники NERV. Эти люди сталкиваются с собственными демонами и конфликтами, в то время как им скрывают истинные цели и значение проекта, в котором они участвуют.
Синдзи оказывается вовлечённым в сложную и опасную реальность, где ему предстоит сражаться с таинственными существами, угрожающими человечеству. Однако борьба не ограничивается лишь физическими столкновениями; он также вынужден противостоять своим страхам и эмоциям, что делает его путь ещё более тернистым. Отношения с другими пилотами, такими как Рей и Асука, также играют важную роль в его развитии, поскольку каждый из них имеет свои собственные травмы и сложности, которые влияют на их взаимодействие.
Тем временем, в самой организации NERV происходят скрытые манипуляции и интриги, которые ставят под угрозу не только жизнь пилотов, но и судьбу всего человечества. Синдзи и его товарищи должны разбираться в своих чувствах, принимать трудные решения и искать смысл в том, что происходит вокруг них, чтобы найти свой путь в этом запутанном и порой мрачном мире.