Воздушный флот организации WILLE успешно завершает операцию в Париже, отражая нападение армии беспилотников. В ходе операции активируется огромный уплотнительный столб, который помогает восстановить город и обеспечивает доступ к необходимым боеприпасам и запчастям для «Евангелионов». Тем временем, Синдзи, охваченный безысходностью после потери Каору и последствия Четвёртого удара, следует за Рэй и Аской. Их путешествие приводит их в Третью деревню — восстановленное поселение, где люди стараются создать атмосферу мирной жизни.
Синдзи, потерявший интерес к своему существованию, пытается справиться с внутренними демонами и горем. Рэй, несмотря на свою природу, поддерживает его, а Аска, полная решимости, ведет их к новым возможностям. В Третьей деревне жители стремятся к восстановлению и примирению, создавая условия для нормальной жизни после разрушительных событий. Синдзи и его спутники сталкиваются с выбором: оставаться в этом новом мире или продолжать борьбу с теми, кто угрожает их спокойствию.
В процессе взаимодействия с местными жителями и другими выжившими, герои начинают осознавать важность взаимопомощи и поддержки. Их путь к исцелению и пониманию собственных чувств становится ключевым элементом в поисках смысла и надежды на будущее. Третья деревня становится символом нового начала, в котором Синдзи, Рэй и Аска должны найти свое место и преодолеть прошлые травмы.
